Doanh Nghiệp FDI Quy Mô Nhỏ Và Vừa Có Được Miễn Thuế TNDN 3 Năm?

Cục Thuế vừa chính thức ban hành Công văn số 3896/CT-CS tháo gỡ vướng mắc lớn về thuế: Doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI) quy mô nhỏ và vừa vẫn được hưởng chính sách miễn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) trong 3 năm đầu nếu đáp ứng đủ các điều kiện luật định.

1. Nội dung cốt lõi của chính sách miễn thuế

Theo hướng dẫn mới nhất từ Cục Thuế dựa trên Nghị quyết 198/2025/QH15 và Nghị định 20/2026/NĐ-CP:

• Mức ưu đãi: Miễn 100% thuế TNDN.
• Thời hạn áp dụng: 03 năm liên tục.
• Thời điểm tính: Kể từ ngày doanh nghiệp được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp (ERC) lần đầu.
• Bình đẳng pháp lý: Chính sách áp dụng đồng nhất cho cả doanh nghiệp trong nước và doanh nghiệp FDI thành lập theo pháp luật Việt Nam.

2. Tiêu chí để doanh nghiệp FDI được xác định là "Nhỏ và Vừa"

Để được hưởng ưu đãi này, doanh nghiệp FDI cần đáp ứng đồng thời các tiêu chí về lao động và tài chính theo Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa (Nghị định 80/2021/NĐ-CP):

• Về lao động: Số lao động tham gia BHXH bình quân năm không quá 200 người.
• Về tài chính (chỉ cần đạt 1 trong 2 tiêu chí):
  • Tổng nguồn vốn không quá 100 tỷ đồng.
  • Doanh thu của năm trước liền kề không quá 300 tỷ đồng.

3. Các trường hợp LOẠI TRỪ (Không được miễn thuế)

Doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý các trường hợp "siết chặt" nhằm tránh trục lợi chính sách sau đây:

- Loại trừ theo hình thức thành lập:

• Doanh nghiệp thành lập mới từ việc: Sáp nhập, hợp nhất, chia, tách.
• Doanh nghiệp do chuyển đổi chủ sở hữu hoặc chuyển đổi loại hình doanh nghiệp.

- Loại trừ do yếu tố nhân sự quản lý (Lưu ý mốc 12 tháng):

• Người đại diện theo pháp luật hoặc cổ đông góp vốn lớn nhất của doanh nghiệp mới thành lập từng tham gia điều hành hoặc góp vốn tại một doanh nghiệp khác đã giải thể chưa đủ 12 tháng (tính đến thời điểm thành lập doanh nghiệp mới).
• Ví dụ: anh A là cổ đông sở hữu 80% Công ty X.
  Tháng 1/2026, Công ty X giải thể.
  Tháng 6/2026, anh A thành lập Công ty Y và tiếp tục là cổ đông lớn nhất.
  Trong trường hợp này, Công ty Y không được hưởng ưu đãi miễn thuế.

- Loại trừ theo nguồn thu nhập:

Không áp dụng miễn thuế đối với các khoản thu nhập đặc thù thuộc diện loại trừ quy định tại Khoản 3 Điều 18 Luật Thuế TNDN số 67/2025/QH15

• Thu nhập từ chuyển nhượng vốn, chuyển nhượng BĐS, chuyển nhượng dự án đầu tư,..
• Thu nhập từ hoạt động tìm kiếm, thăm dò và khai thác dầu khí, tài nguyên quý hiếm
• Thu nhập từ sản xuất, kinh doanh trò chơi điện tử trên mạng
• Thu nhập từ sản xuất, kinh doanh hàng hoá, dịch vụ chịu thuế tiêu thụ đặc biệt (trừ sản xuất lắp ráp oto, tàu lượn, du thuyền,..)

4. Phân tích chuyên sâu cho Doanh nghiệp FDI

Chính sách mới này mang lại 3 tác động và lưu ý lớn cho khối doanh nghiệp FDI:

• Xóa bỏ ranh giới phân biệt đối xử: Trước đây, nhiều địa phương lúng túng trong việc áp dụng ưu đãi doanh nghiệp nhỏ và vừa cho khối FDI. Công văn 3896/CT-CS là "lời khẳng định" giúp doanh nghiệp FDI yên tâm tự khai, tự quyết toán ưu đãi.
• Cơ hội cho dòng vốn khởi nghiệp (Startup/SMEs ngoại): Các dự án FDI quy mô nhỏ, văn phòng đại diện chuyển đổi thành công ty, hoặc các dự án công nghệ, dịch vụ có lượng vốn ban đầu dưới 100 tỷ đồng sẽ tiết kiệm được nguồn lực tài chính rất lớn trong 3 năm đầu để tái đầu tư.
• Rà soát ngay hệ thống hướng dẫn cũ: Cục Thuế đã yêu cầu Cục Thuế TP.HCM và các địa phương dừng các văn bản hướng dẫn cũ nếu đi ngược lại tinh thần này. Doanh nghiệp cần chủ động làm việc với đơn vị tư vấn thuế để cập nhật tờ khai quyết toán thuế TNDN theo đúng form mới.

Nếu doanh nghiệp của bạn thuộc khối FDI mới thành lập, hãy đối chiếu ngay 3 bộ lọc: Tiêu chí quy mô ➡️ Lịch sử nhân sự/Hình thức thành lập ➡️ Danh mục thu nhập loại trừ để tối ưu hóa nghĩa vụ thuế của mình.